جک دلروی، به دنبال پخش یک قسمت ویژه هالووین از برنامه گفتگوی آخر شب خود است به امید اینکه بتواند برنامه خود را از لغو شدن نجات دهد. اما همه چیز آنطور که او برنامه ریزی کرده پیش نمی رود و اتفاقات وحشتناکی در این شب رخ می دهد که ...

سه خلبان که عمیقاً در یک برنامه نظامی فوق محرمانه غرق شده اند، تلاش می کنند تا یک برنامه هوش مصنوعی را قبل از شروع جنگ جهانی بعدی تحت کنترل درآورند.

نئو و رهبران شورش تخمین میزنند که حدود ۷۲ ساعت تا حمله ۲۵۰ هزار ماشین به صهیون، وقت دارند. در همین زمان نئو باید تصمیم بگیرد که چگونه ترینیتی را از سرنوشت تاریکی که در رویایش دیده، نجات دهد.

صهیون، شهر انسان‌ها در مقابل حملات بی امان ماشین‌ها مقاومت می کند، در حالی که نئو در میدانی دیگر، برای خاتمه دادن به این نبرد، با مامور اسمیت سرکش می جنگد.